文章目录

1 材料与方法

1.1 样品来源

1.2 主要试剂

1.3 采集拭子样品的RT-PCR检测

1.4 病毒分离及RT-PCR鉴定

1.5 病毒分离株的全基因组测序及序列分析

    1.5.1 引物设计及合成

    1.5.2 IBV分离株的全基因组序列分析

    1.5.3 IBV分离株基于S1基因的遗传进化分析

2 结果与分析

2.1 采集拭子样品的RT-PCR检测

2.2 IBV分离株全基因序列测序

2.3 IBV分离株全基因组序列分析

2.4 IBV分离株基于S1基因的遗传演化分析

3 讨论

文章摘要:为了解江苏省蛋鸡传染性支气管炎病毒（infectious bronchitis virus, IBV）的主要流行情况,采集江苏省13个地级市20家蛋鸡养殖场鸡群的咽拭子及泄殖腔拭子样品共计625份。除去核酸浓度低于检出下限的120份样品后,通过RT-PCR的方法对余下的505份合格样品进行流行病学检测,并通过病料接种SPF鸡胚分离到1株IBV病毒,对该分离株进行全基因测序及S1基因序列分析。结果显示:505份合格样品中,IBV阳性检出率为14.46%（73/505）。IBV分离株全基因组大小为27 689 bp,其中S1基因1 620 bp,编码540个氨基酸,裂解位点为HRRRR,属于GⅠ-19谱系（QX型）,分离株S1基因的核苷酸和氨基酸序列与GⅠ-19谱系（QX型）参考毒株同源性最高,分别为94%和95.4%。研究结果初步明确了江苏分离株遗传演化特点,为下一步防控工作提供了参考。

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项目基金:文章来源：《药物流行病学杂志》 网址: http://www.ywlxbxzz.cn/qikandaodu/2021/1008/755.html